通過以上對稅務審計報告的內容和格式的大致介紹，可以看出稅務審計報告與注冊會計師審計報告有許多不同之處。

   首先，稅務審計報告收件人與注冊會計師審計報告不同。注冊會計師審計報告的收件人一般是審計業務的委托人，如：股份有限公司的全體股東。而稅務審計報告的收件人是要求實施稅務審計的上級稅務機關或本部門的稅務機關。這是由于稅務審計是稅收征管的一個手段，稅務機關和納稅人或扣繳義務人是一種稅收管理關系。稅務審計的委托人是對納稅人或扣繳義務人有稅收管轄權的有關稅務部門，因此稅務審計的收件人是要求實施審計的稅務機關。

  其次，稅務審計報告意見與注冊會計師審計報告不同。注冊會計師根據審計結果和被審計單位的有關問題的處理情況，形成四種基本類型的審計報告：無保留意見、保留意見、否定意見和無法表示意見的審計報告，主要是就被審計單位會計報表是否符合會計準則和相關準則，是否在所有重點方面公允反映了被審計單位的財務狀況和經營成果。但是，稅務審計報告卻不能采用這種類型的審計意見。這是因為，稅法和會計準則的特點不同。稅法具有剛性的特點，稅法規定納稅人或扣繳義務人在納稅活動中必須按照稅法的規定準確地計算應納稅額，并在規定的期間內進行納稅申報、繳納稅款。而會計準則規定會計人員可以根據單位的實際情況選擇適合本單位的會計政策、會計估計等。由于稅法的剛性原則，稅務審計人員在發表審計意見時必須就納稅人或扣繳義務人的具體的納稅事項做出詳細的審計意見。比如：就所得稅而言，稅務審計人員必須對納稅人的所得稅納稅申報表中的應納稅所得的項目和計算正確性、應納稅所得的調減項目及調減額的計算的正確性等有關項目做出具體的說明。

  最后，稅務審計報告附件里包括的被審計單位的各種稅款的納稅申報表和稅務審計事項說明等內容，而注冊會計師審計報告里沒有附件這一項。正像驗資報告的格式與內容那樣，稅務審計人員在出具審計報告時必須對已經審計的被審計單位的各種稅種的納稅申報表和有關稅務審計事項的說明列在審計報告的附件里面，為稅務審計報告的使用者對被審計單位的納稅情況有全面、詳細的了解。

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